Seiring dengan berkembangnya zaman dan era digital sekaligus di tengah Pandemi Covid-19 saat ini, STAINU Purworejo selalu melaksanakan aktivitas mujahadah setiap pagi sebelum kegiatan akademik dan non akademik dimulai. Program ini merupakan kelanjutan dari program lama STAINU Purworejo yang sudah biasa dilaksanakan oleh sivitas akademika dari masa ke masa. Sehingga dengan melanggengkan kegiatan mujahadah ini, sebagai kampus NU diharapkan seluruh kegiatan akademik dan non akademik maupun hajat-hajat institusi seperti akreditasi, pengembangan institusi dan lainnya dapat terealisasi dengan baik dan lancar sesuai yang diharapkan bersama. Sebagai Perguruan Tinggi NU yang sedang mengalami pertumbuhan dan pengembangan kualitas institusi dari masa ke masa, suasana akademik sebagai representasi pengembangan intelektual di STAINU Purworejo diimbangi dengan nuansa spiritual sebagai wujud keseimbangan dalam mengimplementasikan intelektual dan spiritual SDM kampus.
Menjadi Perguruan Tinggi Nahdlatul Ulama yang Kompetitif dan Unggul Dalam IPTEKS dan Ilmu Keislaman yang Berwawasan Kebangsaan Pada Tahun 2040 
